Il y a 45 ans de cela, une guerre faisait rage entre les humains et leurs droides cylons. Après des mois de combat, un armistice fut signé et les cylons partirent pour un monde qui leur appartiendrait. Chaque année, les humains et les cylons doivent se voir dans une station spatiale éloignée, où ils pourraient avoir des relations diplomatiques. Les humains y envoient quelqu'un mais les cylons n'ont envoyé personne depuis 40 ans. Excepté cette année, une femme blonde arriva accompagnée de deux centurions, puis la station a été détruite. Sur la planète Caprica, l'une des douze colonies de Kobol, un scientifique du nom de Gaius Baltar se laissa séduire par l'une des cylons, il la laissa accéder à l'ordinateur central de la défense coloniale ce qui laissa le champ libre au cylons qui quelques jours plus tard ont atomisé en premier Caprica, Picon, Aérilon et Gemenon. Les autres planètes ont suivi. Les cylons ont, néanmoins échoué. Après la première attaque, il ne restait plus que 45000 personnes en vie dans l'univers. Sur Caprica, les survivants s'organisent, et certains qui n'ont pas froid aux yeux, vont tuer les cylons qui s'installèrent dans la ville de Caprica. Dans l'espace, la bataille fait rage mais les humains s'organisent aussi, les vaisseaux civils et militaires se sont retrouvés et sont sous la protection du Battlestar Galactica. Les Battlestar sont des vaisseaux de guerre militaires construit lors de la première guerre contre les cylons, chaque colonie à son propre Battlestar pour la protéger. Pendant l'attaque cylone, plus de la moitié des militaires ont été vaincus par l'ennemi, mais ce n'est pas maintenant que le battlestar Galactica va céder. Depuis tant d'années, les cylons à l'apparence humaine ont réussi à infiltrer les colonies, certains se faisant passer pour des humains, d'autres ne savent même pas qu'ils sont des cylons. Méfiez vous de votre voisin, il est peut être un cylon qui sait...